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jinshanli至尊木蟲 (知名作家)
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[求助]
單晶存在B錯誤同時也沒判斷出來絕對構型，尋求幫助 已有1人參與
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新測了一個單晶，想要判斷化合物的絕對構型，check結果顯示有B錯誤，同時Flack parameter數(shù)值較大無法判斷手性，麻煩各位給解決一下，非常感謝！ 化合物結構及單晶數(shù)據(jù)請查閱百度網(wǎng)盤。鏈接: https://pan.baidu.com/s/1LCfmu6eNY2ir0mLJ3iUiJg?pwd=yngp 提取碼: yngp 復制這段內容后打開百度網(wǎng)盤手機App，操作更方便哦@jackdeng@lich666 |
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至尊木蟲 (職業(yè)作家)
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【答案】應助回帖
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倒反欒晶，又叫外消旋欒晶，不是內消旋，不好意思打錯了；你的晶體是經(jīng)過表征了，證明是手性純的嘛？Flack參數(shù)x接近于 0.5，現(xiàn)在更流行用Hooft（結構中的Flack是0.65左右，而Hooft是0.57, 更接近0.5，更準確），一個典型的例子發(fā)生在具有P21空間群的單斜晶體，在孿晶區(qū)具有鏡面的對稱性。因此，兩種光學異構的結構都出現(xiàn)，你的結構剛好是這種情況；精修時一個細節(jié)就是：取消你用的AFIX 66后發(fā)現(xiàn)苯環(huán)上六個碳的振動參數(shù)差異很大，并且無序的方向沒有規(guī)律性，也就直接導致了碳碳精度的問題，這說明了結構不是常規(guī)的結構無序振動，而是構型無序，即倒反欒晶，現(xiàn)在的數(shù)據(jù)質量已經(jīng)足夠判斷絕對構型的問題了，更好的情況是等你根據(jù)9樓的意見重收好數(shù)據(jù)后，再做研判 |
jinshanli12樓2022-06-05 20:03:23
2樓2022-06-05 15:22:08
jinshanli
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3樓2022-06-05 15:26:43
4樓2022-06-05 15:31:35
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